Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkraQ9WTX2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms