Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkab1Q9R078 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms