Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pkp3Q9QY23 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp3Q9QY23 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms