Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms