Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf19Q9JLL3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms