Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk3aQ9JKX8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk3aQ9JKX8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms