Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm7Q9ESD6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms