Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc4Q9ES56 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc4Q9ES56 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms