Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf6Q9DBU5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf6Q9DBU5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms