Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fundc1Q9DB70 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms