Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s2Q9DB50 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms