Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smdt1Q9DB10 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smdt1Q9DB10 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms