Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc54Q9DAL3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms