Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim23Q9DAL0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms