Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd9Q9D9M4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd9Q9D9M4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd9Q9D9M4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd9Q9D9M4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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