Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms