Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Alkbh4Q9D8F1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Alkbh4Q9D8F1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Alkbh4Q9D8F1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Alkbh4Q9D8F1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms