Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms