Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med8Q9D7W5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med8Q9D7W5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms