Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D4W2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms