Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl8bQ9D1F0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl8bQ9D1F0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl8bQ9D1F0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl8bQ9D1F0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl8bQ9D1F0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms