Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc167Q9D162 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc167Q9D162 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms