Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed5Q9CXE7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms