Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm8aQ9CWZ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms