Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcf1Q9CTH6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcf1Q9CTH6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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