Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EcdQ9CS74 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EcdQ9CS74 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EcdQ9CS74 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EcdQ9CS74 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EcdQ9CS74 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms