Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16286Q9CQX6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16286Q9CQX6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16286Q9CQX6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16286Q9CQX6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16286Q9CQX6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16286Q9CQX6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms