Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sec61bQ9CQS8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sec61bQ9CQS8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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