Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl41Q9CQN7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms