Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf2Q9CQJ4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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