Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CQF4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQF4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms