Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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