Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms