Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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