Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Derl1Q99J56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl1Q99J56 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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