Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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