Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4ip1Q924D0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms