Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b5Q923D4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms