Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms