Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms