Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApofQ91V80 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms