Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC155Q8N6L0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms