Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms