Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup54Q8BTS4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup54Q8BTS4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup54Q8BTS4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup54Q8BTS4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup54Q8BTS4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup54Q8BTS4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms