Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim19Q80ZU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim19Q80ZU4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms