Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms