Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cep170bQ80U49 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170bQ80U49 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms