Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms