Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NexnQ7TPW1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NexnQ7TPW1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NexnQ7TPW1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NexnQ7TPW1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms