Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpf1Q7TND5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpf1Q7TND5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms